آزمایشهای داکینگ مولکولی
آزمایشهای داکینگ مولکولی
پروتئین‌ها به عنوان واحدهای عملکردی موجودات زنده شناخته شده‌اند و نحوه تعامل این ماکرومولکول‌های حیاتی با مولکولهای کوچک (small molecules) و همچنین ماکرومولکول‌های حیاتی دیگر تعیین کننده اتفاقاتی است که در بدن موجودات زنده رخ می دهد. فعالان حوزه بررسی فعالیت‌های پروتئین از الگوهای تعامل این ماکرومولکول حیاتی با مولکولهای دیگر استفاده می کنند تا ترکیبات جدیدی را به عنوان دارو و یا مواد مغذی (نظیر شیرین‌کننده های مصنوعی) به بازار معرفی نمایند.
داکینگ مولکولی یکی از سریع‌ترین و متداول‌ترین روشهایی است که این الگوهای تعاملی پروتئین (و اسیدهای نوکلئیک) را شناسایی و به محققین عرضه می نماید.
علاقمندان می توانند هم به صورت انتخابی هم به صورت یک رویداد کامل از مباحث این دوره استفاده نمایند.
ارائه گواهی
برای تمامی شرکت کنندگان در دوره‌های آموزشی خصوصی و گروهی گواهی به زبان انگلیسی و با مهر و امضای مدیریت دیارازیست صادر خواهد شد.
گروه‌های هدف و پیش نیازها
سرفصلهای این دوره آموزشی برای رفع نیاز این فراگیران طراحی شده است:
- پژوهشگرانی که به هرشکل در ارتباط با فرایندهای بدن موجودات زنده در حال تحقیق و مطالعه هستند و …
- پژوهشگرانی که می خواهند از روش های مدلسازی مولکولی برای بررسی برهم‌کنش های یک پروتئین (رسپتور، آنزیم) با یک لیگاند استفاده کنند.
- پیش نیاز این قسمت اطلاع از مبانی ساختار پروتئین می باشد: شناخت مفاهیمی مثل پروتئین، رزیدو، اسیدآمینه و اطلاع از انواع مفاهیم مرتبط با پیوندهای شیمیایی نظیر پیوند کووالانس، واندروالس، هیدروژنی، یونی.
چنانچه لازم می دانید که بطور کامل با سرفصل‌هایی که ما در مبانی ساختار پروتئین (مقدماتی) آموزش می دهیم آشنا شوید، کلیک کنید.
در آموزش داکینگ مولکولی، یا همان بررسی برهم‌کنش های یک پروتئین با مولکولهای کوچک (لیگاند اختصاصی) یا با پروتئین دیگر در محیط مجازی آشنا خواهند شد. بطورکلی، ابزارها و الگوریتم‌های داکینگ پروتئین با مولکولهای کوچک از داکینگ با یک پروتئین دیگر متفاوت است ولی سرفصلهای آموزشی مشابه می باشد :
- آشنایی با مفهوم داکینگ مولکولی
- آشنایی با ابزارها و روش های متداول برای انواع داکینگ بر حسب مورد
- تصمیم گیری برای استفاده از متدهای مختلف داکینگ در هر دسته
- انواع برهم کنش های پروتئین- لیگاند/ پروتئین (برحسب مورد) و اهمیت هر یک از برهم کنشها
- نحوه تفسیر نتایج داکینگ
آموزش عملی ⇐ انجام داکینگ روی یک پروتئین؛ اگر از روز قبل ساخته باشید، از همان پروتئین استفاده خواهید کرد، در غیر این صورت از پایگاه داده PDB استخراج می کنید. در این قسمت از ابتدای آماده سازی مولکولها تا انتهای تفسیر نتایج آموزش داده خواهد شد.
مبانی ساختاری پروتئین ها (مقدماتی)
آموزش خصوصی یا دریافت مشاوره
- مزایای این نوع آموزش
در صورت لزوم و برحسب نیازهای دانشجو موارد آموزشی قابل تغییر هستند.
تعداد جلسات برای پوشش تمامی سرفصل های این قسمت با درنظر گرفتن آموزش عملی بطور معمول 6 ساعت یا 4 جلسه یک و نیم ساعته می باشد. در حالت خصوصی تعداد جلسات برحسب سرعت یادگیری و نیاز دانشجو می تواند کمتر شود.
آموزش آنلاین و از طریق اسکای‌روم یا گوگل میت خواهد بود.
در صورت تمایل و درخواست دانشجویان، این شرایط برای دو نفر هم‌زمان هم امکان‌پذیر است، اما هزینه‌ها تغییری نخواهد کرد.
آزمایش داکینگ مولکولی
گروه‌های سه نفر به بالا
آموزش به صورت حضوری خواهد بود و می تواند به شکل یک کارگاه دو روزه (بطور مثال از ساعت 9 الی 13) برگزار شود.
تعداد جلسات برای پوشش تمامی سرفصل های این قسمت با درنظر گرفتن آموزش عملی بطور معمول 6 ساعت یا 4 جلسه یک و نیم ساعته می باشد.
پاسخ به پرسش‌های متداول
برای مشاهده توضیحاتی که در پاسخ به سؤالات دانشجویان درباره دوره های مربوط به «مطالعات مدلسازی مولکولی» داده شده است، روی این لینک کلیک نمایید.
چنانچه سؤال جدیدی برای شما مطرح شده است، لطفا آن را از طریق یکی از راه‌های تماس با ما در میان بگذارید.
دیدگاهتان را بنویسید